Un ecosistema és aquella comunitat inserida en un determinat mitjà i en què conviuen activament els éssers vius que la componen. En tant, un ecosistema aquàtic és aquell que existeix a l'aigua, aleshores, els seus components vius, vegetació i animals conviuen i es desenvolupen a la mateixa aigua.
El nostre planeta disposa de dos tipus d'aigües, salada (oceans i mars) i dolç (llacs, rius, rierols, llacunes, entre d'altres), per tant, els animals i les plantes que viuen en algun d'aquests dos tipus tenen naturals característiques que els permetran subsistir en les condicions que prevalen en els ecosistemes d'aigua esmentats.
No serà el mateix per a un animal adaptat a la vida en aigua salada acomodar-se a les condicions totalment diferents que es plantegen a la dolça. En els casos en què no hi ha adaptació als canvis, les espècies solen desaparèixer.
Qualsevol ecosistema necessita per subsistir de dos tipus d'elements, els biòtics (amb vida) i els abiòtics (sense vida), la interrelació eficient dels quals contribuirà a l'equilibri i la subsistència de l'ecosistema en qüestió.
Entre els primers es destaquen els vegetals, els animals, els fongs i els bacteris, i pels biòtics compten l'aire, el sol, l'aigua, el clima, la temperatura.
Quan parlem d'interacció i de la necessitat que tots els elements esmentats al paràgraf anterior hi siguin presents té a veure amb el fet que els uns als altres es necessiten per mantenir-se i desenvolupar-se a l'ecosistema aquàtic.
Així, els vegetals o zooplàncton són l'aliment bàsic de peixos petitíssims i d'animals aquàtics com la balena i alhora, el zooplàncton necessita sí o sí de l'energia que li aporta la llum solar per poder continuar vivint. Els peixets més petits són l'aliment que necessiten els més grans i la resta de les plantes aquàtiques també serveix d'alimentació als fongs i bacteris que estan en aquest hàbitat.
Cal destacar que els ecosistemes aquàtics tenen una gran rellevància a l'hora del desenvolupament de diverses activitats com l'agricultura, la provisió d'aigua per a consum personal i la producció de certs productes. No obstant això, cal esmentar que la inescrupolosa i deficient acció humana, materialitzada en la contaminació de les aigües, moltes vegades és una amenaça concreta i directa a la continuïtat de la vida i de les espècies.
